Hercules: synthetic biology

हरक्यूलिस सभी जीवविज्ञानी, जेनेटिक इंजीनियरों और बायोकेटिस्टों के लिए एक आवश्यक ऐप है।
हरक्यूलिस क्या है?
यह एक उन्नत, तेज़, आधुनिक और स्लिम टूल है जो पुनः संयोजक अभिव्यक्ति प्रयोगों से प्रोटीन उत्पादन को अधिकतम करने के लिए डिज़ाइन किया गया है। यह अनुक्रमों के बारे में कई उपयोगी अंतर्दृष्टि और विवरण प्रदान करते हुए प्रोटीन अभिव्यक्ति और घुलनशीलता को अनुकूलित करता है। वर्तमान में, ई कोलाई समर्थित मेजबान है। भविष्य में अन्य मेजबानों को शामिल किया जा सकता है।
हरक्यूलिस क्या नहीं है?
यह सुंदर चित्रों के साथ चीजों के परिभाषाओं और स्पष्टीकरण के साथ उन प्रारंभिक शैक्षणिक ऐप्स में से एक नहीं है। माफ़ करना। यदि यहां कुछ भी नहीं है, तो मैं इन सुविधाओं के बारे में अधिक जानने के लिए एक खोज इंजन का उपयोग करने की सलाह दूंगा। मैं ईमेल के माध्यम से ऐप और क्रैश से संबंधित सीमित क्वेरी का समर्थन करता हूं।
विशेषताएं:
- एमआरएनए और प्रोटीन फीचर्स
कई एमआरएनए फीचर्स जैसे कोडन अनुकूलन सूचकांक (सीएआई), टीआरएनए अनुकूलन सूचकांक (टीएआई), जीसी सामग्री, प्रोटीन हाइड्रोफोबिसिटी, लचीलापन और घुलनशीलता की गणना की जाती है। अनुक्रम के साथ इन सुविधाओं का एक प्रोफ़ाइल साजिश भी प्रदर्शित की जाती है। Https://tisigner.com से 'रेजर' सेवा का उपयोग करके सभी अनुक्रमों को सिग्नल पेप्टाइड के लिए स्वचालित रूप से चेक किया जाता है। कई सुविधाएं पूरी तरह से ऑफ़लाइन काम करती हैं।
- एमआरएनए अभिव्यक्ति की भविष्यवाणी और अनुकूलन।
यह कोडन अनुकूलन सूचकांक (काई, शार्प और ली (1 9 87)), टीआरएनए अनुकूलन सूचकांक (ताई, सबी एट अल। (2017)) को अधिकतम करने के पारंपरिक तरीकों का उपयोग करके किया जा सकता है और जीसी सामग्री या आधुनिक को कम करना अनुवाद शुरूआत साइट की पहुंच को ट्यून करके दृष्टिकोण। एक शक्तिशाली, इनबिल्ट मल्टीबेक्टिव ऑप्टिमाइज़ेशन एल्गोरिदम का उपयोग पारंपरिक विधि का उपयोग करके अनुक्रम को अनुकूलित करने के लिए किया जाता है, जबकि, https://tisigner.com से Tisigner सेवा का उपयोग आधुनिक दृष्टिकोण का उपयोग करके अनुक्रम को अनुकूलित करने के लिए किया जाता है।
- प्रोटीन घुलनशीलता की भविष्यवाणी और अनुकूलन
यह घुलनशीलता-भारित सूचकांक (एसडब्ल्यूआई, भंडारी एट अल। (2020)), प्रोटीन घुलनशीलता की भविष्यवाणी करने की एक हालिया, तेज़ और सटीक विधि का उपयोग करके किया जाता है। हरक्यूलिस में प्रोटीन अनुक्रम की घुलनशीलता को अनुकूलित करने के लिए एक अंतर्निहित अनुकूलन एल्गोरिदम होता है।
अन्य छोटी विशेषताएं:
- अनुवाद, पूरक, रिवर्स पूरक और ओलिगो पिघलने तापमान गणना। ये सुविधाएं पोलीमरेज़ चेन रिएक्शन (पीसीआर) प्रयोगों की योजना बनाने के लिए उपयोगी हो सकती हैं।
- आने के लिए ...
कृपया ध्यान दें:
- कृपया ऐप के अंदर 'सहायता' पढ़ें, यदि आप इन सुविधाओं के बारे में अनिश्चित हैं।
- इस ऐप में बिल्कुल कोई विज्ञापन नहीं है, नाटक स्टोर में 'विज्ञापन शामिल' के बावजूद। यह फेसबुक के ऑडियंस नेटवर्क का उपयोग करके एक्सपो एसडीके के कारण है, हालांकि ऐप में लाइब्रेरी को कॉल करने के लिए कोई कोड नहीं है।
- चूंकि कई सुविधाओं को स्थानीय रूप से गणना की जाती है, इसलिए ऐप कम प्रोसेसिंग पावर वाले पुराने फोन में उल्लेखनीय रूप से लग सकता है। इसके बारे में क्षमा करें;)
ज्ञात समस्याएं:
- फाइल सेविंग फीचर बाहरी स्टोरेज के संबंध में Google द्वारा किए गए परिवर्तन के कारण ऐप को नए एंड्रॉइड डिवाइस (एंड्रॉइड 11) पर क्रैश करने का कारण बन सकता है। मैं इस मुद्दे के लिए एक फिक्स पर काम कर रहा हूं।
ओपन सोर्स?
- केंगर्स को हतोत्साहित करने के लिए, यह प्रोजेक्ट वर्तमान में बंद हो गया है। हालांकि, अगर टूल को कुछ कर्षण मिलता है, तो मैं पास के भविष्य में परियोजना को खोलने के लिए खुश हूं। मुझे जितना आप करते हैं उतना खुले स्रोत से प्यार करते हैं और मेरे सभी काम अब तक खुले-सोर्स किए गए हैं।