Hercules: synthetic biology

헤라클레스는 모든 생물 학자, 유전자 엔지니어 및 생화학 자에게 필수 앱입니다.
헤라클레스 란 무엇입니까?
재조합 발현 실험에서 단백질 생산을 극대화하도록 고안된 고급, 빠르고 현대적이고 매끄러운 도구입니다. 그것은 단백질 발현과 용해도를 최적화하면서 많은 도움이되는 통찰력과 시퀀스에 대한 설명을 제공합니다. 현재 E. coli는 지원되는 호스트입니다. 다른 호스트는 미래에 포함될 수 있습니다.
어떤 헤라클레스가 아닌가? 죄송합니다. 여기에 당신에게 의미가 없으면 검색 엔진을 사용하여 이러한 기능에 대해 더 많이 알 수 있습니다. 나는 앱과 관련된 제한된 쿼리를 지원하고 이메일을 통해 충돌을 지원합니다.
특징 :
- mRNA 및 단백질 특징 코돈 적응 지수 (CAI), TRNA 적응 지수 (TAI), TRNA 적응 지수 (TAI), GC 함량, 단백질 소수성, 유연성 및 용해도가 계산됩니다. 시퀀스를 따라 이러한 기능의 프로파일 플롯도 표시됩니다. 모든 시퀀스는 https://tisigner.com에서 'Razor'서비스를 사용하여 신호 펩타이드에 대해 자동으로 확인됩니다. 많은 기능이 완전히 오프라인으로 작동합니다.
mRNA 표현의 예측 및 최적화.
CAI, SHARP 및 LI (1987)), TRNA 적응 지수 (TAI, SAVI et al. (2017))를 극대화하는 기존의 방법을 사용하여 GC 함량이나 현대를 최소화하는 기존의 방법을 사용하여 수행 할 수 있습니다. 번역 개시 사이트의 접근성을 조정하여 접근합니다. 강력하고 Inbuilt 다중 용지 최적화 알고리즘은 기존의 방법을 사용하여 시퀀스를 최적화하는 데 사용되는 반면, https://tisigner.com의 Tisigner 서비스는 현대적인 접근 방식을 사용하여 시퀀스를 최적화하는 데 사용됩니다.
- 단백질 용해도의 예측 및 최적화
이는 단백질 용해도를 예측하는 최근, 빠르고 정확한 방법 인 용해도 가중 인덱스 (SWI, Bhandari et al. (2020))를 사용하여 수행됩니다. 헤라클레스는 단백질 시퀀스의 용해도를 최적화하기 위해 Inbuilt 최적화 알고리즘을 가지고 있습니다.
- 번역, 보체, 역 보체 및 올리고 녹는 온도 계산. 이러한 기능은 PCR (Polymerase Chain Reaction)을 계획하는 데 유용 할 수 있습니다.
앱 안에있는 '도움말'을 읽으십시오. 이러한 기능에 대해 확실하지 않습니다.
'광고가 포함되어있는'라는 Play 스토어에도 불구 하고이 앱에는 절대적으로 광고가 없습니다. 응용 프로그램도 라이브러리를 호출 할 코드가 없지만 이것은 페이스 북의 대상 네트워크를 사용하여 엑스포 SDK 때문이다
- 매매. 많은 기능이 로컬로 계산되기 때문에 앱이 낮은 프로세싱 파워와 오래된 휴대폰에 띄게 느려질 수 있습니다. 죄송합니다.)
알려진 문제점 :
오픈 소스?
kangers를 낙담시키기 위해이 프로젝트는 현재 닫힙니다. 그러나 도구가 약간의 견인을 얻으면 근처의 미래에 프로젝트를 오픈하는 것이 행복합니다. 나는 당신이하는만큼 오픈 소스를 좋아하며 지금까지 모든 일이 열려있는 것입니다.